学校1980年成立文书档案室，1984年成立综合档案室，隶属于院长办公室。1990年12月晋升安徽省机关档案管理二级先进单位，1998年1月晋升科技事业单位档案管理国家二级单位（皖档发[1998]3号）。档案工作作为学校整体工作的重要组成部分，纳入了学校整体发展规划，与学校各项工作实行了布置、检查、总结、验收“四同步”管理。
综合档案室于2005年升格为副处级建制，隶属于学校党政办公室。2013年11月19日学校召开院长办公会，会议决定：根据工作需要，学校综合档案室更名为档案馆，副处级建制，挂靠学校党政办公室。岗位编制3人，馆长1名，秘书1名，工作人员1名。
根据工作需要，经学校2014年6月20日校长办公会议研究决定，学校档案馆升格为正处级建制，岗位编制4人，馆长1名，副馆长1名，秘书1名，干部人事档案管理人员1名。