计算机应用研究所成立于2004年，是依托于计算机与信息学院并采用“院所一体化”管理模式的校级科研机构。研究所旨在整合计算机信息类相关学科的研究资源，开展计算机应用领域的学术研究和技术开发工作，以提高学院的整体科研水平、应用型创新人才的培养水平、以及服务地方经济社会发展的能力。
研究所现有研究人员50人，其中具有高级职称人员14人，具有博士学位人员6人。经过多年建设，研究所已形成计算机建模与仿真、信号与信息处理、人工智能、物联网等多个稳定的学术研究团队，以及嵌入式系统开发、信息安全技术开发、物联网技术开发、企事业单位信息化服务等多个稳定的技术开发团队。
研究所已购置频谱分析仪、示波器、信号发生器、LCR测试仪等测试设备，物联网创新开发套件、嵌入式系统开发平台、虚拟仪器开发系统、DSP开发系统等开发平台，小型机、服务器、高性能电脑等计算设备，科研设备价值200余万元，能满足研究所科技研发的需求。
近年来，研究所积极开展计算机应用研究，取得了较为丰硕的成果，获国家发明专利1项、软件著作权6项，获安徽省科学技术奖2项。热忱欢迎高等院校、科研院所、企事业单位和个人参与合作研发，研究所将竭诚为广大同仁提供优越的平台和优良的服务。