DNA条形码简介(一)

发布时间:2011-07-22文章来源: 浏览次数:

条形码技术(Barcode techniques)是为实现对信息的自动扫描而设计的,它在零售业的发展过程中起到了重要作用,节省了交易时间,提高了销售效率。随着分子生物学技术和生物信息学的发展,基于DNA barcoding技术进行鉴定和分类的研究已成为生物分类学研究中引人注目的新方向和研究热点。关于DNA barcoding的大量报道见诸于相关学术刊物和其他媒体上,如Science,Nature,PNAS,The NewYork Times¨,National Geographic News等。生物条形码协会(Consortium for the Barcode of Life)已有40个国家的130多个研究单位参与其中。生物条形码网站http://www、barcodinglife.con,真菌编码网站http://www.allfungi.org/,鳞翅目编码网站http://www.lepbarcoding.org/,鱼类编码网站http://www.fishbo1.org/等网站相继建立,2007年5月10日,世界上第一个DNA barcoding鉴定中心在加拿大University of Guelph成立。本文综述了DNA barcoding技术的研究现状,并就该技术在中药材鉴定中应用的技术方法、技术路线、关键问题以及应用范围等方面开展研究进行了论述,为建立中药材DNA barcoding鉴定技术奠定基础。

1.DNA条形码的定义

在DNA分类学(DNA Taxonomy,即以DNA序列作为生物分类系统平台)的基础上,加拿大动物学家Paul Hebert等对动物界,包括脊椎动物和无脊椎动物共11门13,320个物种的线粒体细胞色素C氧化酶亚基1(Cytochrome C oxidase I,CO I)基因序列比较分析,除腔肠动物Cnidaria外,98%的物种遗传距离差异在种内0%~2%,种间平均可达到11.3%,据此提出可以用单一的小片段基因来代表物种,作为物种的条形编码,为全球生物‘编码’,即DNA barcoding(DNA条形码)是利用一段标准DNA序列作为标记来实现快速、准确和自动化的物种鉴定,类似于超市利用条形码扫描区分成千上万种不同的商品。由于Paul Hebert首先倡导将条形码编码技术应用到生物物种鉴定中,因此他被称为DNA条形编码之父。

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